Bactériologie expérimentale

L’Unité de Bactériologie Expérimentale (UBE) est une Unité de Recherche dirigée par le Pr Amy Gassama Sow, Professeur Titulaire des Universités en Bactériologie-Virologie qui a sous sa responsabilité un technicien supérieur et un agent de laboratoire. L’unité accueille depuis 2014, le Dr Guillaume Constantin de Magny, chargé de recherche de l’unité MIVEGEC (IRD/CNRS/UM).

La thématique principale de recherche de l’Unité est : Antibiorésistance et Infections entériques.

Le problème est abordé avec une double approche : fondamentale utilisant les techniques les plus performantes de biologie moléculaire et appliquée tout en ne perdant pas de vue l’intérêt de cette recherche pour la prise en charge des patients et la compréhension de la diffusion des souches et des résistances aux antibiotiques.

Autour de cette thématique, plusieurs activités sont développées :

Suivi de l’antibiorésistance des souches d’entérobactéries selon l’approche « One Health »
Epidémiologie moléculaire et la résistance aux antibiotiques des bactéries entériques
Evaluation des risques microbiologiques liés aux aliments et à l’environnement
Veille microbiologique
Développement d’outils diagnostic de détection des pathogènes alimentaires dans les aliments et l’environnement

Equipe

Pr Amy Gassama sow
Chef d’unité

Guillaume de Magny

Dr Bissoum SAMB

Activités de Recherche

Dynamique épidémiologique du choléra et de l’écologie de Vibrio cholerae.
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Epidémiologie moléculaire et la résistance aux antibiotiques des bactéries entériques
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Etude des communautés étiologiques des fièvres d’origine bactérienne
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Etude des communautés microbiennes intestinales en rapport avec la malnutrition infanto-juvénile
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Evaluation des risques microbiologiques liés aux aliments : Prévention de maladies diarrhéiques et de l’antibiorésistance
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Suivi de l’antibiorésistance des souches d’entérobactéries selon l’approche « One Health »
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Enseignement

Microbiologie clinique (DUT, DIT)
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Surveillance et le diagnostic au laboratoire des agents microbiologiques responsables de gastroentérites
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Bissoum Samb-Ba, Mamadou Hadi Diallo , Abdoulaye Seck , Abdoul Aziz Wane , Guillaume Constantin de Magny, Cheikh Saad-Bouh Boye , Ahmad Iyane Sow, Amy Gassama-Sow.2017. Identification of atypical El Tor V. cholerae O1 hosting unusual SXT element in Senegal, Frontiers in Microbiology vol 8. Article 748. DOI: 10.3389/fmicb.2017.00748

Thomas Jove, Sandra Da Re, Aurore Tabesse, Amy Gassama Sow, Marie-Cécile Ploy. 2017. Gene expression in class 2 integron is SOS-Dependent and involves two Pc promoters. Frontiers in Microbiology vol 8. Article 1499. DOI: 10.3389/fmicb.2017.001499

Timbiné L. G., Wane A. A., Fall N. K., Abdou M., Barro N., Sangaré L., Bougoudogo F., Gassama Sow A. 2013. Sensibilité aux antibiotiques des souches de bactéries entéropathogènes isolées en Afrique de l’Ouest (Burkina Faso, Mali, Sénégal), Dakar Med. 58 (2) : 80-88

Amy Gassama Sow, Awa Aïdara-Kane , Olivier Barraud, Martine Gatet, François Denis, and Marie-Cécile Ploy. 2010. High prevalence of trimethoprim resistance cassettes in class 1 and 2 integrons in Senegalese Shigella spp isolates. J. Infect. Dev. Ctries (JIDC): 4 (4), 207-212

B. Sambe-Ba, A. Seck, L.G. Timbine, A.A. Wane, A. Gassama-Sow. 2013. Emergence of quinolone resistance in Salmonella and Shigella strains isolated from diarrhoea in Senegal. Journal of Global Antimicrobial Resistance. doi:10.1016/j.jgar.2013.06.004

publications

bacteriologie

Bactériologie expérimentale

Equipe

Pr Amy Gassama sow
Chef d’unité

Guillaume de Magny

Dr Bissoum SAMB

Activités de Recherche

Dynamique épidémiologique du choléra et de l’écologie de Vibrio cholerae.

Epidémiologie moléculaire et la résistance aux antibiotiques des bactéries entériques

Etude des communautés étiologiques des fièvres d’origine bactérienne

Etude des communautés microbiennes intestinales en rapport avec la malnutrition infanto-juvénile

Evaluation des risques microbiologiques liés aux aliments : Prévention de maladies diarrhéiques et de l’antibiorésistance

Suivi de l’antibiorésistance des souches d’entérobactéries selon l’approche « One Health »

Infections entériques

Veille microbiologique

Enseignement

Microbiologie clinique (DUT, DIT)

Antibiologie

Surveillance et le diagnostic au laboratoire des agents microbiologiques responsables de gastroentérites

Publications

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bacteriologie

Bactériologie expérimentale

Equipe

Pr Amy Gassama sow Chef d’unité

Guillaume de Magny

Dr Bissoum SAMB

Activités de Recherche

Dynamique épidémiologique du choléra et de l’écologie de Vibrio cholerae.

Epidémiologie moléculaire et la résistance aux antibiotiques des bactéries entériques

Etude des communautés étiologiques des fièvres d’origine bactérienne

Etude des communautés microbiennes intestinales en rapport avec la malnutrition infanto-juvénile

Evaluation des risques microbiologiques liés aux aliments : Prévention de maladies diarrhéiques et de l’antibiorésistance

Suivi de l’antibiorésistance des souches d’entérobactéries selon l’approche « One Health »

Infections entériques

Veille microbiologique

Enseignement

Microbiologie clinique (DUT, DIT)

Antibiologie

Surveillance et le diagnostic au laboratoire des agents microbiologiques responsables de gastroentérites

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Pr Amy Gassama sow
Chef d’unité