Les thèmes de recherche de l'unité de Bactériologie médicale et environnementale sont centrés sur les infections bactériennes et virales. Ces travaux font appels à une approche multidisciplinaire associant études cliniques, études de génétique des populations bactériennes, de la pathogénie et des résistances aux antibiotiques. L'unité s'est récemment intéressée à l'évaluation quantitative des risques dans le domaine de la sécurité sanitaire des aliments. La majeure partie des projets de recherche de l'unité est réalisée en collaboration avec les structures hospitalières locales, les Instituts membres du Réseau International des Instituts Pasteur et l'Institut Pasteur à Paris.
L'unité est affiliée à l'école doctorale des Sciences de la vie, de la santé et de l'environnement (Université Cheikh Anta Diop, Dakar).
